Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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