Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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Smg9Q9DB90 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smg9Q9DB90 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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