Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Usp12Q9D9M2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms