Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmigd1Q9D7L8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms