Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lonrf3Q9D4H7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms