Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rdm1Q9CQK3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rdm1Q9CQK3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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