Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms