Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Hdac9Q99N13 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hdac9Q99N13 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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