Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp1b4Q99ME6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms