Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 284.1 ms