Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms