Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pacsin3Q99JB8 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pacsin3Q99JB8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Pacsin3Q99JB8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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