Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim11aQ99J19 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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