Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rdh10Q8VCH7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rdh10Q8VCH7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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