Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssh3Q8K330 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssh3Q8K330 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssh3Q8K330 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssh3Q8K330 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssh3Q8K330 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssh3Q8K330 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ssh3Q8K330 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ssh3Q8K330 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ssh3Q8K330 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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