Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mtmr3Q8K296 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mtmr3Q8K296 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mtmr3Q8K296 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mtmr3Q8K296 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mtmr3Q8K296 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mtmr3Q8K296 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mtmr3Q8K296 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mtmr3Q8K296 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms