Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SbsnQ8CIT9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.59□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SbsnQ8CIT9 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms