Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIG8

Prmt5, Protein arginine N-methyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt5Q8CIG8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Prmt5Q8CIG8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Prmt5Q8CIG8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Prmt5Q8CIG8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Prmt5Q8CIG8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms