Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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