Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms