Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ufl1Q8CCJ3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ufl1Q8CCJ3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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