Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms