Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg4aQ8C9S8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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