Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Hdac7Q8C2B3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hdac7Q8C2B3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hdac7Q8C2B3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms