Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf428Q8C1M2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf428Q8C1M2 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms