Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm16559-201ENSMUST00000160080 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms