Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms