Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms