Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp40Q8BWR4 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp40Q8BWR4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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