Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp1Q8BJQ2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp1Q8BJQ2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Usp1Q8BJQ2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usp1Q8BJQ2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms