Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdca8Q8BHX3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdca8Q8BHX3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms