Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-M10.2Q85ZW9 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms