Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APTXQ7Z2E3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms