Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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PhkbQ7TSH2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PhkbQ7TSH2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PhkbQ7TSH2 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PhkbQ7TSH2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PhkbQ7TSH2 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PhkbQ7TSH2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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PhkbQ7TSH2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PhkbQ7TSH2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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PhkbQ7TSH2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PhkbQ7TSH2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms