Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Dsg1cQ7TSF0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms