Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim12Q78RX3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms