Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnih3Q6ZWS4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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