Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LcorQ6ZPI3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LcorQ6ZPI3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms