Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trak1Q6PD31 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trak1Q6PD31 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms