Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zbtb40Q6PCS8 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zbtb40Q6PCS8 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Zbtb40Q6PCS8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Zbtb40Q6PCS8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Zbtb40Q6PCS8 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zbtb40Q6PCS8 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zbtb40Q6PCS8 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Zbtb40Q6PCS8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Zbtb40Q6PCS8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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