Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp49Q6P9L4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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Usp49Q6P9L4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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