Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rcbtb1Q6NXM2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms