Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
CltbQ6IRU5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms