Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Tpm4Q6IRU2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Tpm4Q6IRU2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tpm4Q6IRU2 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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