Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Ccdc18Q640L5 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc18Q640L5 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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