Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Sall3Q62255 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall3Q62255 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms