Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sema3cQ62181 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sema3cQ62181 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sema3cQ62181 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sema3cQ62181 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sema3cQ62181 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms