Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm13778-202ENSMUST00000146633 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm19412-202ENSMUST00000189156 569 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm8488-201ENSMUST00000176112 1280 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gli3Q61602 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms