Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot7Q60809 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot7Q60809 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms