Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Psme4Q5SSW2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms